潮州地区人乳头瘤病毒52型E6多态性分析
摘要:
目的:明确潮州地区人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)52型E6编码区的基因多态性.方法:提取101例HPV 52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过特异性引物扩增HPV 52-E6编码区全序列,成功获得83份HPV 52-E6 PCR扩增阳性产物,进行测序及BLAST多态性分析.结果:成功获得76条HPV 52-E6基因全序列(447 bp).该序列与参考株(GQ472848)的一致性为99%.在潮州地区发现11种E6编码区多态性,9种为同义突变,2种有义突变,引起所编码氨基酸 改变.根据基因多态性分亚洲群和欧美群2群.亚洲群有7组,第1组,也是最为常见组(50/76)的编码序列与广州(EU924143)和香港 (DQ057293)株编码完全匹配,该组称为潮州地方株;第2组(12/76)多态性与广州(EU924144)等报道的E6全序列完全匹配;第3组 (仅1例)多态性与浙江大学报道(HM004117)的E6全序列完全匹配;其余4组多态性国际上尚未报道.欧美群有3组,第1组(5/76)多态性与美 国(HQ537745)报道的E6全序列完全匹配;第2组(2例)多态性与美国(DQ057291)和德国(X74481)报道的E6全序列完全匹配;第 3组(1例)多态性国际上尚未报道.结论:潮州地区HPV 52-E6编码区序列存在多态性,以中国东南部和东南亚国家报道E6编码区序列为主,少数与欧美报道E6全序列完全匹配.为基因疫苗的研制提供了科学依 据.
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DOI:
10.3969/j.issn.0253-3626.2012.03.009
被引量:
年份:
2012
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