Open Mass Spectrometry Search Algorithm

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140

作者:

LY GeerSP MarkeyJA KowalakL WagnerM XuDM MaynardX YangW ShiSH Bryant

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摘要:

Large numbers of MS/MS peptide spectra generated in proteomics experiments require efficient,sensitive and specific algorithms for peptide identification.In the Open Mass Spectrometry Search Algorithm(OMSSA),specificity is calculated by a classic probability score using an explicit model for matching experimental spectra to sequences.At default thresholds,OMSSA matches more spectra from a standard protein cocktail than a comparable algorithm.OMSSA is designed to be faster than published algorithms in searching large MS/MS datasets.

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DOI:

10.1016/j.gie.2007.11.009

被引量:

2327

年份:

2004

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